Immaterielle rettigheter kan være en utfordring ved samarbeidsprosjekter slik klynger er. Det kan være at det er helt avklart og dette løser seg mellom virksomhetene.
Men ved innovasjonsprosjekter anbefales det å diskutere mulige løsninger i forkant, og lage avtale partene imellom. Vedlagte håndbok gir god veiledning hvordan håndtere immaterielle rettigheter i klynger.